Universitetsmuseet har ansvar for innsamling, dokumentasjon, bevaring, forskning og formidling innenfor sine museale fagfelt. Fagfeltene er antropologi, arkeologi og kunst og kulturhistorie, botanikk, geologi og zoologi.
Her er noen av Norges største samlinger av kultur- og naturhistoriske gjenstander og bl.a. disse er grunnlaget for forskningen og formidlingen ved museet. Som universitetsmuseum har museet omfattende vitenskapelige samlinger, og muséet er et regionalt kompetanse- og formidlingssentrum.
Ett av Bergens vakreste signalbygg, Museplassen 3 rommer de nye naturhistoriske utstillingene og ble endelig gjenåpnet høsten 2019 etter omfattende rehabilitering.